Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nek8Q91ZR4 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms