Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CipcQ8R0W1 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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