Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp1Q8BJQ2 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp1Q8BJQ2 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp1Q8BJQ2 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp1Q8BJQ2 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Usp1Q8BJQ2 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp1Q8BJQ2 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms