Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Dsg1bQ7TSF1 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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