Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Obp2b-201ENSMUST00000114192 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4349-201ENSMUST00000181809 2559 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Thnsl1-202ENSMUST00000102951 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Dad1-202ENSMUST00000128231 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ivl-201ENSMUST00000053107 1922 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm37818-201ENSMUST00000194952 3169 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl2-201ENSMUST00000035090 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Gtpbp6Q3U6U5 Fanca-201ENSMUST00000035495 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Sp1-202ENSMUST00000163709 3134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Prnd-204ENSMUST00000110172 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 D230017M19Rik-203ENSMUST00000181973 1649 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Sub1-201ENSMUST00000022816 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r12a-201ENSMUST00000070663 3403 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Rpusd1-201ENSMUST00000047273 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnna1-201ENSMUST00000042345 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms