Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Siah1bQ06985 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms