Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Pkp1P97350 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 911.8 ms