Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CtshP49935 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CtshP49935 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms