Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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