Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
H2-Q1O19441 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
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H2-Q1O19441 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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H2-Q1O19441 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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H2-Q1O19441 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Q1O19441 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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