Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc180J3QNE4 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc180J3QNE4 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc180J3QNE4 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc180J3QNE4 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc180J3QNE4 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc180J3QNE4 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ccdc180J3QNE4 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc180J3QNE4 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc180J3QNE4 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc180J3QNE4 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccdc180J3QNE4 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccdc180J3QNE4 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc180J3QNE4 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms