Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Gm20830J3KML6 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms