Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm4858-203ENSMUST00000195847 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm15464-201ENSMUST00000118718 431 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm13576-201ENSMUST00000120851 778 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm15694-201ENSMUST00000121984 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm14573-201ENSMUST00000150544 451 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm6851-201ENSMUST00000154478 395 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm28038F7BCN9 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms