Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc6D3YZP9 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc6D3YZP9 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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