Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usf3B2RUQ2 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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