Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Spocd1B1ASB6 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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