Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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