Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Rabgef1Q9JM13 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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