Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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OtofQ9ESF1 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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OtofQ9ESF1 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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OtofQ9ESF1 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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OtofQ9ESF1 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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OtofQ9ESF1 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
OtofQ9ESF1 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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