Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Usp29Q9ES63 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms