Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Rnft1Q9DCN7 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rnft1Q9DCN7 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms