Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc47Q9D024 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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