Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Pacsin3Q99JB8 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms