Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NischQ80TM9 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NischQ80TM9 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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