Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms