Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Ccdc18Q640L5 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Ccdc18Q640L5 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Ccdc18Q640L5 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccdc18Q640L5 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ccdc18Q640L5 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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