Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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