Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms