Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
VdrP48281 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
VdrP48281 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
VdrP48281 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
VdrP48281 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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