Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrprbP47758 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SrprbP47758 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms