Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29567-201ENSMUST00000191188 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28222-201ENSMUST00000191210 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28776-201ENSMUST00000191282 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29306-201ENSMUST00000191366 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29618-201ENSMUST00000191423 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28136-210ENSMUST00000191432 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm29251-201ENSMUST00000191480 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm28658-201ENSMUST00000191532 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm32180-201ENSMUST00000192415 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm30598-201ENSMUST00000192620 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm37627-201ENSMUST00000194585 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm34274-201ENSMUST00000195825 615 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp4P35123 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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