Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb1P28230 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms