Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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