Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Ggta1P23336 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ggta1P23336 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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