Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Ptpn9O35239 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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Ptpn9O35239 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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