Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Usp9yF8VPU6 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms