Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cttnbp2B9EJA2 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms