Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Scn3aA2ASI5 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms