Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CtcflA2APF3 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms