Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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