Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Trim12aQ99PQ1 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Trim12aQ99PQ1 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Trim12aQ99PQ1 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Trim12aQ99PQ1 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
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