Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprtQ99M80 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprtQ99M80 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprtQ99M80 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprtQ99M80 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
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PtprtQ99M80 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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PtprtQ99M80 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
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