Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Dsg1bQ7TSF1 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.3 ms