Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Actn1Q7TPR4 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Actn1Q7TPR4 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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