Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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Ccdc88cQ6VGS5 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ccdc88cQ6VGS5 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms