Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Usp49Q6P9L4 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp49Q6P9L4 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp49Q6P9L4 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp49Q6P9L4 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp49Q6P9L4 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp49Q6P9L4 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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