Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ctnna3Q65CL1 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms