Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Shank3Q4ACU6 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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