Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Pkp1P97350 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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