Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms